Results
  model coordinates only   fit to EM map   vs reference structure   vs other models   ligands   Comparative Analyses
         help
  Model Ranks (per target)   Models Pair-wise Comparison   Scores Pair-wise Comparison   Group Ranks (across targets)
 
Target: 
Scores: 
Filter by method: ab-initio  optimized cryoEM model  optimized other known model  not optimized  ab-initio+optimized (mixed)
    
Filter by effort:    fully automated    partially automated, with some manual steps    manual              
Model: 
Ligand Scores 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 Q-score PTQ 0.33:T0201EM001_1 0.65:T0201EM001_2 0.62:T0201EM001_3 0.55:T0201EM002_1 0.72:T0201EM002_2 0.60:T0201EM002_3 0.71:T0201EM003_1 0.71:T0201EM003_1,T0201EM003_2 0.03:T0201EM003_3 0.71:T0201EM003_1,T0201EM003_2,T0201EM004_1 0.45:T0201EM004_2 0.73:T0201EM005_1 0.81:T0201EM005_2 0.79:T0201EM006_1 0.31:T0201EM007_1 0.78:T0201EM009_1 0.69:T0201EM010_1 0.64:T0201EM011_1 0.81:T0201EM005_2,T0201EM012_1 0.63:T0201EM013_1 0.82:T0201EM014_1 0.77:T0201EM015_1 0.71:T0201EM003_1,T0201EM003_2,T0201EM004_1,T0201EM6cvm 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 Q-score F86 0.61:T0202EM001_1 0.59:T0202EM001_2 0.68:T0202EM002_2 0.68:T0202EM002_2,T0202EM003_1 0.68:T0202EM002_2,T0202EM003_1,T0202EM003_2 0.74:T0202EM004_1 0.50:T0202EM004_2 0.68:T0202EM002_2,T0202EM003_1,T0202EM003_2,T0202EM005_1 0.69:T0202EM006_1 0.57:T0202EM007_1 0.63:T0202EM008_1 0.71:T0202EM009_1 0.68:T0202EM002_2,T0202EM003_1,T0202EM003_2,T0202EM005_1,T0202EM010_1 0.56:T0202EM011_1 0.68:T0202EM002_2,T0202EM003_1,T0202EM003_2,T0202EM005_1,T0202EM010_1,T0202EM012_1 0.59:T0202EM001_2,T0202EM013_1 0.74:T0202EM004_1,T0202EM7bv2 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 Q-score PEE 0.60:T0203EM001_1 0.66:T0203EM001_2 0.63:T0203EM001_3 0.72:T0203EM002_1 0.72:T0203EM002_1,T0203EM002_2 0.69:T0203EM002_3 0.73:T0203EM003_1 0.73:T0203EM003_1,T0203EM003_2 0.76:T0203EM004_1 0.26:T0203EM004_2 0.74:T0203EM005_1 0.71:T0203EM006_1 0.51:T0203EM007_1 0.61:T0203EM008_1 0.71:T0203EM006_1,T0203EM009_1 0.73:T0203EM003_1,T0203EM003_2,T0203EM010_1 0.72:T0203EM002_1,T0203EM002_2,T0203EM011_1 0.75:T0203EM012_1 0.67:T0203EM014_1 0.77:T0203EM016_1 0.76:T0203EM004_1,T0203EM7kjr 64 32 16 8 4 2 1 0 HOH clash 1.25:T0201EM001_1 1.03:T0201EM001_2 1.08:T0201EM001_3 40.15:T0201EM002_1 20.10:T0201EM002_2 52.49:T0201EM002_3 0.21:T0201EM003_1 0.60:T0201EM003_2 0.73:T0201EM003_3 2.12:T0201EM005_1 2.12:T0201EM005_1,T0201EM005_2 2.49:T0201EM006_1 0.53:T0201EM008_1 5.21:T0201EM009_1 3.05:T0201EM010_1 1.64:T0201EM012_1 2.73:T0201EM013_1 16.52:T0201EM014_1 0.83:T0201EM015_1 6.44:T0201EM6cvm 46.23:T0202EM002_1 42.47:T0202EM002_2 0.28:T0202EM003_2 1.44:T0202EM005_1 1.88:T0202EM006_1 7.83:T0202EM009_1 6.67:T0202EM013_1 5.47:T0203EM001_2 1.70:T0203EM001_3 28.28:T0203EM002_1 28.28:T0203EM002_1,T0203EM002_2 29.03:T0203EM002_3 1.25:T0201EM001_1,T0203EM005_1 68.85:T0203EM007_1 2.20:T0203EM009_1 6.67:T0202EM013_1,T0203EM010_1 1.72:T0203EM012_1 15.52:T0203EM014_1 6.08:T0203EM016_1 4.92:T0203EM7kjr 0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 Confal,% (RNA conformer) 93.90:T0202EM001_1 87.80:T0202EM001_2 78.30:T0202EM002_2 81.80:T0202EM003_1 83.30:T0202EM003_2 86.40:T0202EM004_1 27.80:T0202EM004_2 86.40:T0202EM004_1,T0202EM005_1 95.20:T0202EM006_1 57.30:T0202EM007_1 93.20:T0202EM008_1 94.60:T0202EM009_1 97.20:T0202EM010_1 84.80:T0202EM011_1 87.80:T0202EM001_2,T0202EM012_1 86.40:T0202EM004_1,T0202EM005_1,T0202EM013_1 86.40:T0202EM004_1,T0202EM005_1,T0202EM013_1,T0202EM7bv2 64 32 16 8 4 2 1 0 MM (strain energy) 2.60:T0201EM001_1 6.30:T0201EM001_2 2.40:T0201EM001_3 18.30:T0201EM002_1 11.70:T0201EM002_2 18.80:T0201EM002_3 8.70:T0201EM003_1 8.10:T0201EM003_2 3.50:T0201EM003_3 8.80:T0201EM004_1 8.90:T0201EM004_2 9.40:T0201EM005_1 6.00:T0201EM005_2 4.90:T0201EM006_1 4.40:T0201EM007_1 6.10:T0201EM008_1 5.60:T0201EM009_1 8.10:T0201EM003_2,T0201EM010_1 6.60:T0201EM011_1 7.40:T0201EM012_1 7.70:T0201EM013_1 4.20:T0201EM014_1 5.30:T0201EM015_1 6.40:T0202EM001_1 5.50:T0202EM001_2 8.00:T0202EM002_2 4.70:T0202EM003_1 4.90:T0201EM006_1,T0202EM003_2 6.70:T0202EM004_1 6.70:T0202EM004_1,T0202EM004_2 7.00:T0202EM005_1 7.30:T0202EM006_1 2.80:T0202EM007_1 6.80:T0202EM008_1 7.20:T0202EM009_1 7.90:T0202EM010_1 3.50:T0201EM003_3,T0202EM011_1 7.00:T0202EM005_1,T0202EM012_1 8.00:T0202EM002_2,T0202EM013_1 14.00:T0203EM001_1 6.40:T0202EM001_1,T0203EM001_2 14.80:T0203EM001_3 27.80:T0203EM002_1 19.60:T0203EM002_2 29.00:T0203EM002_3 15.30:T0203EM003_1 7.10:T0203EM003_2 9.50:T0203EM004_1 14.80:T0203EM001_3,T0203EM004_2 10.10:T0203EM005_1 19.60:T0203EM002_2,T0203EM006_1 15.90:T0203EM007_1 16.20:T0203EM008_1 15.90:T0203EM007_1,T0203EM009_1 12.20:T0203EM010_1 16.50:T0203EM011_1 6.80:T0202EM008_1,T0203EM012_1 21.60:T0203EM014_1 17.00:T0203EM016_1 0.20:T0203EM017_1 0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 PH4 (placement score) 53.30:T0201EM001_1 58.87:T0201EM001_2 56.00:T0201EM001_3 71.74:T0201EM002_1 73.19:T0201EM002_2 61.06:T0201EM002_3 57.98:T0201EM003_1 57.19:T0201EM003_2 44.52:T0201EM003_3 52.59:T0201EM004_1 50.39:T0201EM004_2 53.37:T0201EM005_1 66.59:T0201EM005_2 65.15:T0201EM006_1 57.70:T0201EM007_1 78.37:T0201EM008_1 63.72:T0201EM009_1 48.22:T0201EM010_1 61.59:T0201EM011_1 74.26:T0201EM012_1 51.67:T0201EM013_1 78.72:T0201EM014_1 81.04:T0201EM015_1 3.56:T0202EM001_1 6.13:T0202EM002_2 6.50:T0202EM003_1 7.06:T0202EM003_2 6.38:T0202EM004_1 5.44:T0202EM004_2 5.63:T0202EM005_1 5.69:T0202EM006_1 5.63:T0202EM005_1,T0202EM007_1 5.06:T0202EM008_1 5.06:T0202EM008_1,T0202EM009_1 7.06:T0202EM003_2,T0202EM010_1 5.19:T0202EM011_1 6.56:T0202EM012_1 4.31:T0202EM013_1 5.15:T0203EM001_1 11.95:T0203EM001_2 11.30:T0203EM001_3 5.10:T0203EM002_1 11.45:T0203EM003_1 11.45:T0203EM003_1,T0203EM003_2 14.05:T0203EM004_1 14.10:T0203EM004_2 7.50:T0203EM005_1 11.65:T0203EM006_1 8.40:T0203EM007_1 7.10:T0203EM008_1 5.40:T0203EM009_1 14.30:T0203EM010_1 11.10:T0203EM011_1 12.60:T0203EM012_1 9.65:T0203EM014_1 13.75:T0203EM016_1 4.70:T0203EM017_1 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 Mogul composite score 0.17:T0201EM001_1 0.34:T0201EM001_2 0.23:T0201EM001_3 0.08:T0201EM002_1 0.08:T0201EM002_1,T0201EM002_2 0.12:T0201EM002_3 0.10:T0201EM003_1 0.09:T0201EM003_2 0.24:T0201EM003_3 0.14:T0201EM004_1 0.14:T0201EM004_1,T0201EM004_2 0.26:T0201EM005_1 0.36:T0201EM005_2 0.45:T0201EM006_1 0.23:T0201EM001_3,T0201EM007_1 0.75:T0201EM008_1 0.37:T0201EM009_1 0.86:T0201EM010_1 0.31:T0201EM011_1 0.59:T0201EM012_1 0.26:T0201EM005_1,T0201EM013_1 0.94:T0201EM014_1 0.55:T0201EM015_1 0.14:T0201EM004_1,T0201EM004_2,T0201EM6cvm 0.40:T0202EM001_1 0.39:T0202EM001_2 0.01:T0202EM002_1 0.02:T0202EM002_2 0.20:T0202EM003_1 0.21:T0202EM003_2 0.32:T0202EM004_1 0.32:T0202EM004_1,T0202EM004_2 0.05:T0202EM005_1 0.50:T0202EM006_1 0.21:T0202EM003_2,T0202EM007_1 0.55:T0201EM015_1,T0202EM008_1 0.52:T0202EM009_1 0.51:T0202EM010_1 0.13:T0202EM011_1 0.40:T0202EM001_1,T0202EM012_1 0.16:T0202EM013_1 0.32:T0202EM004_1,T0202EM004_2,T0202EM7bv2 0.53:T0203EM001_1 0.50:T0202EM006_1,T0203EM001_2 0.41:T0203EM001_3 0.45:T0201EM006_1,T0203EM002_1 0.41:T0203EM001_3,T0203EM002_2 0.46:T0203EM002_3 0.36:T0201EM005_2,T0203EM003_1 0.37:T0201EM009_1,T0203EM003_2 0.37:T0201EM009_1,T0203EM003_2,T0203EM004_1 0.52:T0202EM009_1,T0203EM004_2 0.02:T0202EM002_2,T0203EM005_1 0.49:T0203EM006_1 0.47:T0203EM007_1 0.64:T0203EM008_1 0.45:T0201EM006_1,T0203EM002_1,T0203EM009_1 0.77:T0203EM010_1 0.64:T0203EM008_1,T0203EM011_1 0.67:T0203EM012_1 0.31:T0201EM011_1,T0203EM014_1 0.40:T0202EM001_1,T0202EM012_1,T0203EM016_1 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Reference-free Scores worse 128 64 32 16 8 4 2 better Clashscore 2.81:T0201EM001_1 3.05:T0201EM001_2 3.62:T0201EM001_3 31.67:T0201EM002_1 6.32:T0201EM002_2 58.85:T0201EM002_3 10.60:T0201EM003_1 11.72:T0201EM003_2 11.72:T0201EM003_2,T0201EM003_3 260.68:T0201EM004_1 109.51:T0201EM004_2 3.86:T0201EM005_1 3.67:T0201EM005_2 5.78:T0201EM006_1 1.56:T0201EM007_1 0.56:T0201EM008_1 5.88:T0201EM009_1 2.70:T0201EM010_1 16.83:T0201EM011_1 3.17:T0201EM012_1 3.37:T0201EM013_1 2.80:T0201EM014_1 15.85:T0201EM015_1 3.63:T0201EM6cvm 0.24:T0202EM001_1 0.95:T0202EM001_2 19.15:T0202EM002_1 11.58:T0202EM002_2 1.30:T0202EM003_1 62.30:T0202EM003_2 101.77:T0202EM004_1 22.72:T0202EM004_2 6.31:T0202EM005_1 2.97:T0202EM006_1 2.54:T0202EM007_1 0.12:T0202EM008_1 5.87:T0202EM009_1 2.45:T0202EM010_1 2.49:T0202EM011_1 4.35:T0202EM012_1 0.23:T0202EM013_1 5.48:T0202EM7bv2 2.91:T0203EM001_1 2.70:T0201EM010_1,T0203EM001_2 1.62:T0203EM001_3 10.53:T0203EM002_1 10.53:T0203EM002_1,T0203EM002_2 26.74:T0203EM002_3 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