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  model coordinates only   fit to EM map   vs reference structure   vs other models   Comparative Analyses
         help
  Global Accuracy   Local Accuracy
 
  Scores   Plots
 
Target: 
Filter by method: ab-initio  optimized cryoEM model       fully automated partially automated, with some manual steps     
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#     Model     Group
    Name
Method EM Map TemPy Phenix     EMRinger
    score
    Q-score Atom Inclusion Refmac
    ab-initio/
    optimized
    auto/
    man.
    MapID     Res
    ol.
    CCC     CCC
    (ov)
    LAP     ENV     MI
    x100
    MI
    (ov)

    x100
    SMOC     box CC     CC(mask)     CC(vol)     CC(peaks)     Resol.(FSC=0.5)     All     BB     FSCavg.
    Orig.
    Model
     noH     Orig.
    Model
     noH     Orig.
    Model
     BF=0      Orig.
    Model
     BF=0      Orig.
    Model
     BF=0      Orig.
    Model
     BF=0      Orig.
    Model
     BF=0      Orig.
    Model
     noH     Orig.
    Model
     noH
1 T0104EM035_1 phenix ab-initio man. emd_0406 2.9 0.32 0.49 0.20 0.98 0.98 3.80 23.97 0.74 0.74 0.64 0.78 0.85 0.85 0.85 0.84 0.56 0.76 2.98 3.01 5.15 0.65 0.65 0.65 0.65 0.77 0.42
2 T0104EM027_1 kumar ab-initio man. emd_0406 2.9 0.32 0.49 0.20 0.98 0.98 3.79 24.10 0.74 0.74 0.65 0.78 0.85 0.84 0.85 0.84 0.57 0.76 3.00 3.04 4.78 0.65 0.65 0.64 0.64 0.76 0.42
3 T0104EM010_1 yu ab-initio man. emd_0406 2.9 0.32 0.48 0.20 0.98 0.98 3.79 23.62 0.74 0.74 0.74 0.77 0.89 0.83 0.87 0.83 0.70 0.75 2.95 2.97 4.69 0.66 0.66 0.64 0.64 0.75 0.41
4 T0104EM091_1 chiu optimized man. emd_0406 2.9 0.32 0.48 0.20 0.98 0.98 3.73 23.21 0.73 0.73 0.74 0.77 0.89 0.83 0.88 0.82 0.70 0.75 2.95 2.98 4.92 0.65 0.65 0.64 0.64 0.76 0.41
5 T0104EM041_1 arpwarp ab-initio man. emd_0406 2.9 0.32 0.48 0.19 0.98 0.98 3.77 22.72 0.73 0.73 0.78 0.77 0.91 0.83 0.88 0.82 0.76 0.74 2.97 3.01 3.03 0.64 0.64 0.63 0.63 0.74 0.41
6 T0104EM073_1 singharoy optimized auto emd_0406 2.9 0.32 0.48 0.19 0.98 0.98 3.73 22.93 0.72 0.72 0.76 0.76 0.82 0.82 0.82 0.81 0.73 0.73 3.01 3.01 5.58 0.64 0.64 0.63 0.63 0.76 0.41
7 T0104EM041_2 arpwarp ab-initio auto emd_0406 2.9 0.32 0.47 0.19 0.99 0.99 3.58 21.56 0.73 0.73 0.74 0.75 0.89 0.82 0.86 0.80 0.70 0.71 2.99 3.05 3.96 0.63 0.63 0.62 0.62 0.74 0.40
8 T0104EM090_1 mbaker ab-initio man. emd_0406 2.9 0.31 0.46 0.18 0.98 0.98 3.60 20.81 0.71 0.71 0.61 0.73 0.80 0.80 0.80 0.79 0.51 0.70 3.08 3.11 2.62 0.61 0.61 0.61 0.61 0.75 0.39
9 T0104EM028_1 ccpem ab-initio man. emd_0406 2.9 0.31 0.48 0.19 0.98 0.98 3.78 23.07 0.71 0.71 0.73 0.75 0.90 0.82 0.89 0.81 0.69 0.73 2.95 3.03 4.84 0.63 0.63 0.62 0.62 0.74 0.41
10 T0104EM025_1 cdmd optimized auto emd_0406 2.9 0.31 0.46 0.18 0.98 0.98 3.69 20.67 0.71 0.71 0.73 0.73 0.79 0.79 0.79 0.79 0.70 0.70 3.12 3.12 4.25 0.60 0.60 0.61 0.61 0.75 0.39
11 T0104EM082_1 rosetta ab-initio man. emd_0406 2.9 0.31 0.49 0.19 0.98 0.98 3.85 24.43 0.66 0.73 0.73 0.75 0.88 0.82 0.86 0.81 0.70 0.72 2.98 3.04 5.11 0.50 0.63 0.33 0.64 0.75 0.41
12 T0104EM082_2 rosetta ab-initio man. emd_0406 2.9 0.31 0.49 0.19 0.98 0.98 3.87 23.87 0.66 0.73 0.76 0.75 0.88 0.82 0.86 0.81 0.73 0.72 2.97 3.03 5.05 0.51 0.64 0.32 0.64 0.75 0.41
13 T0104EM073_2 singharoy optimized auto emd_0406 2.9 0.31 0.45 0.18 0.98 0.98 3.65 19.33 0.69 0.69 0.73 0.73 0.78 0.78 0.78 0.78 0.69 0.69 3.11 3.11 3.92 0.60 0.60 0.61 0.60 0.75 0.39
14 T0104EM6nbb - - - emd_0406 2.9 0.31 0.45 0.18 0.98 0.98 3.70 19.68 0.70 0.70 0.69 0.73 0.84 0.78 0.83 0.78 0.63 0.69 3.09 3.12 3.75 0.59 0.59 0.60 0.60 0.75 0.38
15 T0104EM060_1 deeptracer ab-initio man. emd_0406 2.9 0.29 0.41 0.15 0.98 0.98 3.37 15.35 0.62 0.63 0.64 0.64 0.67 0.67 0.68 0.68 0.56 0.56 3.42 3.42 2.18 0.46 0.50 0.45 0.54 0.71 0.33
16 T0104EM054_2 kihara ab-initio man. emd_0406 2.9 0.29 0.44 0.16 0.98 0.98 3.54 17.51 0.59 0.65 0.65 0.66 0.75 0.70 0.73 0.70 0.58 0.59 3.31 3.33 3.39 0.41 0.53 0.30 0.56 0.69 0.35
17 T0104EM060_2 deeptracer ab-initio man. emd_0406 2.9 0.28 0.40 0.14 0.98 0.98 3.35 15.17 0.61 0.62 0.62 0.62 0.66 0.66 0.66 0.66 0.55 0.55 3.42 3.42 2.78 0.45 0.49 0.45 0.54 0.70 0.32
18 T0104EM054_1 kihara ab-initio man. emd_0406 2.9 0.27 0.41 0.14 0.98 0.98 3.43 14.80 0.56 0.61 0.61 0.61 0.67 0.63 0.65 0.64 0.53 0.52 3.57 3.57 1.61 0.35 0.47 0.29 0.51 0.65 0.31
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